Музей Амурского филиала Морского государственного университета имени адмирала Г.И. Невельского (Благовещенского речного командного училища) был открыт 20 декабря 1979 года.
Музей создавался руками преподавателей, сотрудников и курсантов речного училища в память о лучших представителях первого учебного заведения в Дальневостом регионе по подготовке командных кадров для судов Амурского бассейна. Целью музея является сохранение истории Благовещенского речного командного училища, ставшего филиалом Морского государственного университета.
Первым заведующим музея был Сергей Иванович
Коношец, выпускник штурманского отделения училища 1950 года.